히가시별원의 명칭은 「진종 오타니파 욧카이치 별원」이라고 합니다.
에도 시대 중반, 현재의 동별원 근처에 히가시혼간지(교토)에 신쇼지(真勝寺)라는 절이 있었습니다. 그 주직종순은 히가시혼간지(東本願寺)에서 은거를 명할 수 있지만, 그것을 불복으로 하고 산하 11개 절과 신도 1300명과 함께 니시혼간지(西本願寺)파로 전종하려고 했기 때문에 대소동이 되어 1743년에도의 사찰 봉행 오오카 에치젠 모리 타다시의 심판을 받습니다. 그 결과, 마카쓰지는 절에 몰수되고, 그 후 히가시 혼간지에 건네지게 되어, 히가시 혼간지의 별원·고보가 되었습니다.
막부 말기에 본당은 소실했습니다만(그 후 재건), 웅대한 산문은 지금도 남아, 2005년에 현 지정 유형 문화재가 되었습니다.